交通运输部环境保护中心是交通运输部直属事业单位，具有交通运输行业环境管理、监测、科学研究与开发三大职能，在交通运输环境保护工作中发挥参谋与助手作用、桥梁与纽带作用、交通运输环保科技进步的催化作用。
中心具有雄厚的技术力量和技术储备，硕士学位以上人员占技术人员的40%以上，高级技术职称的人员占30%以上。专业学科涵盖环境工程、海洋工程、海事管理、环境科学、环境监测、海洋生态学、环境规划与管理、水土保持、化学、景观园林、交通工程等。
中心拥有各类资质，包括：环境保护部颁发的建设项目环境影响评价资质（甲级）、水利部颁发的水土保持方案资质（4星）、国家认监委颁发的实验室计量认证证书等。
作为交通运输部直属事业单位，中心积极履行“三定”方案中的相关职责，承担货参与交通运输环保科研及咨询、开发项目。
中心建有以交通运输行业环境监测和溢油应急产品检测为主的检测实验室。检测业务主要包括溢油分散剂、船用吸油毡和溢油吸附材料等产品性能的检测，地面水和废水、环境噪声、环境空气和废气等环境质量监测和污染源监测。